Next Generation Sequencing (NGS) braucht in der Virologie zuverlässige, schnelle und hochqualitative Ergebnisse. Virtualisierung und Cloud-basierte Storage-Konzepte sind für die Medizintechnik wahre Innovations-Booster. Das Ulmer Genetikum konnte jetzt die Performance seiner Sequenzanalysen signifikant steigern.
Das Genetikum, Ulm, hat auf eine hyperkonvergente Infrastruktur aus Server- und Storage- Modulen gewechselt. Der Erfolg: eine 300prozentige Performance-Steigerung.
(Bild: Genetikum)
In der Medizintechnik erzielt die deutsche Industrie einen weltweiten Umsatz in Höhe von 33,4 Milliarden Euro (Quelle: 2019, BVMed). Innovation gehört hier zum Tagesgeschäft. Längst ist die IT dabei nicht mehr nur reine Informationstechnologie, sondern gilt als Schlüsselfaktor für den Innovationsvorsprung. Skalierbarkeit, Virtualisierung und cloudbasierte Storage-Konzepte geben Unternehmen wie dem Genetikum aus Ulm dabei den richtigen Performance-Schub.
Das Genetikum
Das Genetikum ist eine unabhängige, überregionale Gemeinschaftspraxis für genetische Diagnostik, Beratung und Vorsorge mit angeschlossenem Labor an fünf Standorten in Süddeutschland. Als Zentrum für genetische Pränataldiagnostik, Sydromologie, familiäre Tumor- und seltene Erkrankungen vereint das Genetikum humangenetische Diagnostik und fachärztliche Beratung und steht mit einem mehr als 100-köpfigen Team Kliniken, Instituten, Ärztinnen und Ärzten als auch Patientinnen und Patienten in ganz Deutschland zur Seite.
In 30 Jahren Firmengeschichte erfolgten über eine Viertel Million Analysen, Untersuchungen und Beratungen. Die eingesetzte NGS-Technologie in der Pränataldiagnostik, Syndromologie und in der Virologie sequenziert nicht zuletzt SARS-CoV-2-Viren zuverlässig, schnell und hochqualitativ.
Eine Daten-Archivierung, die medizintechnische Anforderungen erfüllt, benötigt sichere und langfristge Backup-Konzepte, kluges Vernetzen von Kurz- und Langzeitarchivierung sowie die Vorbereitung und Sicherstellung von Datenabrufen über letztlich die gesamte Lebenszeit eines Menschen unter Nutzung einer zu verschlüsselnden Personal-ID. Der Zugriff für Prozessbeteiligte muss sicher, ortsunabhängig und mit einer revisionssicheren Speicherung gestaltet werden.
Bereinigung der Server-Storage-Szenerie
Die über die Jahre gewachsenen fragmentierten Serverlandschaft und das dezentrale Storage des Genetikum passten nicht mehr zu den immer schnelleren Sequenzanalysen und den allen Beteiligten gestiegenen Ansprüchen an Service, Automatisierung und Digitalisierung. Um dem Wachstum freie Bahn zu machen und mehr Performance für die Analysen zu ermöglichen, kümmerte sich der Dienstleister Systemzwo Group aus Ulm um die Bereinigung der Server-Storage-Szenerie.
Letztlich musste nicht einmal die gesamte Infrastruktur umgebaut und ausgetauscht werden. Geplante Redundanzen sorgten für eine hohe Ausfallsicherheit, und um der Datensicherheit gerecht zu werden, sollten keine Daten in Clouds dritter Anbieter überführt werden.
Stattdessen hatte Michael Krug, IT-Leiter des Genetikum, genaue Vorstellungen, wie die Migration ablaufen sollte: „Uns war wichtig, dass der Umbau reibungslos über die Bühne geht und es insbesondere bei unseren zeitkritischen Arbeiten zu keinerlei Unterbrechungen kommt und wir Downtimes möglichst vermeiden können. Unser Ziel war es auch, weg von den Insellösungen hin zu einer zentralen Einheit zu kommen, die sowohl die analytischen Anforderungen der Sequenziergeräte als auch weitere Applikationen aus den Managementbereichen verzahnt.”
300 Prozent Performance-Steigerung durch Virtualisierung
Während des laufenden Betriebes fand der reibungslose Wechsel auf eine flexible, hyperkonvergente Infrastruktur aus Server- und Storage- Modulen statt, mit dem Ziel, eine private Cloud sowie ein Daten-Management nach dem Konzept einer Data Fabric einzurichten. Die Realisierung erfolgte mit dem Partner Netapp, mit der die Systemzwo Group 240 Terabyte Daten und 50 virtuelle Maschinen migrierte und einen „3S Object Storage“ einrichtete.
Ein Datenvolumen 240 Terabyte entspricht etwa dem eines Strom- und Wasserversorgers einer mittelgroßen Stadt. Mit fünf All-Flash-basierten Hosts, die mit 2x25 Gigabit ans System angebunden sind, und entsprechenden State-of-the-Art Switch-Systemen konnte die Systemzwo für das Genetikum einen Performance-Gewinn von 300 Prozent erreichen.
„Das erlaubt uns jetzt, mehr und zugleich schneller auswerten zu können. Umgehende Befunde sind für die einsenden Ärzte und Patienten essentiell“, so Krug. „Systemzwo hat sich als Experte der ‘sanften Migration’ bewiesen“, lobt der IT-Leiter. „Unsere Anwender haben nichts von der Migration mitbekommen. Dass im Storage-bereich jetzt Cloud-Technologie zum Einsatz kommt, garantiert uns zukünftige Skalierbarkeit. Die benötigen wir zwingend, um Innovationen in der Humangenetik voranzubringen um weiterhin ganz vorne mitspielen zu können.”
Über die Systemzwo Group
Die Systemzwo Group aus in Süddeutschland, bestehend aus den Gesellschaften Systemzwo GmbH und Kraftwerk, sowie 3 IT GmbH, bietet System- und Beratungsdienstleistungen in der Informations- und Telekommunikationstechnologie an. Rund 50 Mitarbeiter bedienen international und branchenunabhängig bei Mittelstands- und Enterprise-Kunden die Schwerpunkte Informations- und Datensicherheit, IT-Basisinfrastruktur, Speicheranwendungen, Client Services, Infrastruktursoftware sowie E-Mail und Collaboration-Lösungen. Mit der Unternehmensbeteiligung an der Citysens GmbH kann die Gruppe auch Themen aus dem Umfeld von IoT, Sensorik und kameragestützte Analysesysteme anbieten.
Stand vom 30.10.2020
Es ist für uns eine Selbstverständlichkeit, dass wir verantwortungsvoll mit Ihren personenbezogenen Daten umgehen. Sofern wir personenbezogene Daten von Ihnen erheben, verarbeiten wir diese unter Beachtung der geltenden Datenschutzvorschriften. Detaillierte Informationen finden Sie in unserer Datenschutzerklärung.
Einwilligung in die Verwendung von Daten zu Werbezwecken
Ich bin damit einverstanden, dass die Vogel IT-Medien GmbH, Max-Josef-Metzger-Straße 21, 86157 Augsburg, einschließlich aller mit ihr im Sinne der §§ 15 ff. AktG verbundenen Unternehmen (im weiteren: Vogel Communications Group) meine E-Mail-Adresse für die Zusendung von redaktionellen Newslettern nutzt. Auflistungen der jeweils zugehörigen Unternehmen können hier abgerufen werden.
Der Newsletterinhalt erstreckt sich dabei auf Produkte und Dienstleistungen aller zuvor genannten Unternehmen, darunter beispielsweise Fachzeitschriften und Fachbücher, Veranstaltungen und Messen sowie veranstaltungsbezogene Produkte und Dienstleistungen, Print- und Digital-Mediaangebote und Services wie weitere (redaktionelle) Newsletter, Gewinnspiele, Lead-Kampagnen, Marktforschung im Online- und Offline-Bereich, fachspezifische Webportale und E-Learning-Angebote. Wenn auch meine persönliche Telefonnummer erhoben wurde, darf diese für die Unterbreitung von Angeboten der vorgenannten Produkte und Dienstleistungen der vorgenannten Unternehmen und Marktforschung genutzt werden.
Falls ich im Internet auf Portalen der Vogel Communications Group einschließlich deren mit ihr im Sinne der §§ 15 ff. AktG verbundenen Unternehmen geschützte Inhalte abrufe, muss ich mich mit weiteren Daten für den Zugang zu diesen Inhalten registrieren. Im Gegenzug für diesen gebührenlosen Zugang zu redaktionellen Inhalten dürfen meine Daten im Sinne dieser Einwilligung für die hier genannten Zwecke verwendet werden.
Recht auf Widerruf
Mir ist bewusst, dass ich diese Einwilligung jederzeit für die Zukunft widerrufen kann. Durch meinen Widerruf wird die Rechtmäßigkeit der aufgrund meiner Einwilligung bis zum Widerruf erfolgten Verarbeitung nicht berührt. Um meinen Widerruf zu erklären, kann ich als eine Möglichkeit das unter https://support.vogel.de abrufbare Kontaktformular nutzen. Sofern ich einzelne von mir abonnierte Newsletter nicht mehr erhalten möchte, kann ich darüber hinaus auch den am Ende eines Newsletters eingebundenen Abmeldelink anklicken. Weitere Informationen zu meinem Widerrufsrecht und dessen Ausübung sowie zu den Folgen meines Widerrufs finde ich in der Datenschutzerklärung, Abschnitt Redaktionelle Newsletter.